Il campionato 88-89 segna il ritorno dei rossoneri in Coppa Campioni dopo 9 anni, e l'esplosione di Marco van Basten: 19 gol in campionato e 9 in Europa. Quattro di fila ai sedicesimi, contro il Vitocha Sofia, uno decisivo contro la Stella Rossa, 2 al Real Madrid, di cui uno splendido colpo di testa a volo d'angelo e la doppietta nella finale contro la Steaua Bucarest.
Segna anche nella finale vittoriosa di Supercoppa Europea contro il Barcellona e in Coppa Intercontinentale contro l'Atletico Nacional. A questo punto il secondo Pallone d'oro è un atto dovuto. Dietro di lui di nuovo due compagni di squadra: Baresi e Rijkaard.
La stagione sucessiva è caratterizzata dall'operazione al menisco che lo ferma 2 mesi e vede il Milan battuto sul filo di lana dal Napoli, ma van Basten può consolarsi col titolo di capocannoniere (19 gol) e soprattuto con la seconda Coppa dei Campioni vinta sul Benfica, grazie ad un suo assist illuminante per Rijkaard.
1990: ancora una Coppa Intercontinentale e una Supercoppa Europea. Nel '91 stesso copione, poi arriva la notte di Marsiglia in cui il Milan perde la testa. Quarti di finale di Coppa dei Campioni, gara di ritorno con l'Olympique Marsiglia. Galliani impone ai giocatori di abbandonare il campo sull'1-0 per i Francesi, dopo che uno dei riflettori dello stadio si spegne a pochi minuti dalla fine. Nonostante il riflettore venga poi risistemato, il Milan non torna sul prato e viene squalificato per un anno dalle Coppe.
Molti giudicano questo episodio come la fine dell'era Sacchi. Il quadro si completa con le voci che danno van Basten e il mister in rotta di collisione, al punto da arrivare a un aut aut del tecnico di Fusignano, conclusosi poi col suo passaggio in Nazionale e l'arrivo sulla panchina del Milan di Fabio Capello.
| Nome | Marcel (detto Marco) van Basten |
| Soprannome | Il cigno di Utrecht |
| Nazione | Olanda |
| Data di nascita | 31 ottobre 1964 |
| Altezza | 188 cm |
| Peso | 80 kg |
| Squadra | Milan |
| Ruolo | Attaccante |
| Piede preferito | Destro |
| Età alla vittoria | 25 |
| Carriera | 1982-87 Ajax (133 presenze, 128 gol) 1987-95 Milan (147 presenze, 90 gol) |
| Trofei con i club | 1982, 83 e 85 Campionato olandese, Ajax 1983, 86 e 87 Coppa d'Olanda, Ajax 1988, 92, 93 e 94 Campionato italiano, Milan 1988, 92, 93 e 94 Supercoppa italiana, Milan 1987 Coppa delle Coppe, Ajax 1989, 90 e 94 Coppa dei Campioni, Milan 1989, 90 e 94 Supercoppa Uefa, Milan 1989 e 90 Coppa Intercontinentale, Milan 1988 Campionato d'Europa, Olanda |
| Trofei individuali |
1984, 85, 86 e 87 Capocannoniere della Eredivisie |

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